Организовано и открыто в 1965 году.

Первый заведующий отделением (1965-1969 гг) врач высшей категории Токарева Галина Николаевна.
С 1969 по 1986 гг заведовал отделением хирург высшей категории Федоренко Олег Степанович.
С 1986 по 1995 – Марченко Виктор Алексеевич.
С 1995 по 2003 гг. отделение вновь возглавил Федоренко О.С.

С 2003 по 2016 год отделением руководил д.м.н. профессор кафедры онкологии НГМУ, онколог высшей квалификационной категории Фурсов Сергей Александрович.

С 2016 года отделением руководит к.м.н., ассистент кафедры онкологии, онколог высшей квалификационной категории Рягузов Максим Евгеньевич,стаж работы по специальности 18 лет.

Онкологическое отделение№1 — специализированное отделение на 60 коек, оказывающее квалифицированную, онкологическую помощь больным Новосибирской области и города Новосибирска  преимущественно   со злокачественными  заблеваниями желудочно-кишечного тракта. Внедрены современные высокотехнологичные методики оперативного и комплексного лечения    рака желудка с различными видами расширенных лимфодиссекций, колоректального рака с применением сфинктеросохраняющих, нервосберегающих, пластических, комбинированных и расширенных вмешательств,  лапароскопические операции на толстой кишке. Технологии обширной резекции печени и локальной деструкции при первичном и метастатическом поражении. Вмешательства на щитовидной железе  и лимфатическом аппарате шеи в виде расширенных и комбинированных операций. В отделении проводятся наряду с основным  хирургическим, другие методы специального лечения: химиотерапия и в  составе комбинированного лечения лучевая терапия. Отделение осуществляет организационно-методическую и практическую помощь при плановых   выездах в районы области, является клинической базой подготовки врачей-интернов, клинических ординаторов  кафедры онкологии НГМУ.

Ведётся активная научно-исследовательская работа,  защищены  1 докторская и 4 кандидатские диссертации. В настоящее время (в рамках кандидатских диссертаций) объектом исследования служат доброкачественные и злокачественные заболевания толстой кишки, меланома.
Телефон отделения: (383) 382-80-63